基金公司申报增值税出现异常,系扣除数过大,系统无法判断是否正确,需要带上资料(公章,执照,申报表,基金公司出具的能证明数据准确的资料,例如台账并且加盖券商的章子)去税务局做异常比对,比对通过后才可以申报。